Haziran 2010 tarihinden bu yana verilen e-pasaportların güvenlik özelliklerinden biri olan ve pasaportlara elektronik özellikleri kazandıran yonga içerisine başvuru sahibine ait parmak izi verisinin saklanması, yonga ile sınır kapılarındaki yonga okuma terminalleri arasındaki veri alışverişini düzenleyen teknolojinin yeterince güvenli olmaması ile diğer bazı teknik nedenlerden dolayıuygulamaya alınmamıştır.

Gerek yonga teknolojisinde sağlanan gelişim gerekyeni teknolojilerin birçok ülke tarafından devreye alınması bağlamında Emniyet Genel Müdürlüğü'nün yürüttüğü parmak izlerinin e-pasaport yongalarına yerleştirilmesi çalışmaları, Dışişleri Bakanlığımız tarafından da beraberinde sürdürülmüş ve yazılım geliştirme faaliyetleri büyük ölçüde tamamlanmıştır. Sözkonusu yeni uygulamayaAğustos-Eylül2016 döneminde başlanması öngörülmektedir.